任何手术都有其一定的并发症，人工耳蜗植入手术也存在风险。通常分为与手术相关的并发症和与装置相关的并发症。
1．皮瓣并发症是最常见的，常包括：缝线裂开、感染、气肿、血肿与伤口潮湿。
2．面神经刺激
3．眩晕、耳鸣
4．电极脱位
5．胆脂瘤、化脓性中耳炎
6．脑脊液耳瘘、脑膜炎
7．脑梗塞
8．装置失灵